Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarca5Q91ZW3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms