Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atl3Q91YH5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atl3Q91YH5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms