Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdha8Q91Y12 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms