Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Basp1Q91XV3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms