Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx11Q91WL6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx11Q91WL6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms