Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx15Q91WE1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms