Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dcaf11Q91VU6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dcaf11Q91VU6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms