Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms