Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf130Q8VEM1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms