Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps4aQ8VEJ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms