Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf4Q8VE97 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srsf4Q8VE97 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms