Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam20bQ8VCS3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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