Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef3Q8VCC8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef3Q8VCC8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms