Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b4Q8QZY9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms