Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pitrm1Q8K411 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pitrm1Q8K411 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitrm1Q8K411 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms