Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rdh16f2Q8K3M1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rdh16f2Q8K3M1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rdh16f2Q8K3M1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh16f2Q8K3M1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rdh16f2Q8K3M1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rdh16f2Q8K3M1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rdh16f2Q8K3M1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rdh16f2Q8K3M1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rdh16f2Q8K3M1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16f2Q8K3M1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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