Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prpf39Q8K2Z2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms