Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc12Q8K2L8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc12Q8K2L8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms