Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J7

Rell1, RELT-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rell1Q8K2J7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rell1Q8K2J7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rell1Q8K2J7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms