Protein–RNA interactions for Protein: Q8K214

Scmh1, Polycomb protein SCMH1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scmh1Q8K214 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scmh1Q8K214 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms