Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nek9Q8K1R7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek9Q8K1R7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms