Protein–RNA interactions for Protein: Q8K072

Reep4, Receptor expression-enhancing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep4Q8K072 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep4Q8K072 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep4Q8K072 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms