Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms