Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwnkQ8CIW5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms