Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkiras1Q8CEC5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkiras1Q8CEC5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms