Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SynpoQ8CC35 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SynpoQ8CC35 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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