Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A430089I19RikQ8C9W1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms