Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa5Q8C7G5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms