Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc90bQ8C3X2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms