Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TiparpQ8C1B2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TiparpQ8C1B2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms