Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne1Q8C166 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms