Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms