Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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