Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbbp5Q8BX09 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp5Q8BX09 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms