Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Usp38Q8BW70 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp38Q8BW70 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp38Q8BW70 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp38Q8BW70 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms