Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms