Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap20Q8BTU1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap20Q8BTU1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms