Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms