Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI4

Gen1, Flap endonuclease GEN homolog 1, mousemouse

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gen1Q8BMI4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gen1Q8BMI4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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