Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik4Q8BMF5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grik4Q8BMF5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms