Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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