Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clrn3Q8BHH8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clrn3Q8BHH8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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