Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a7Q8BGY9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Slc5a7Q8BGY9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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