Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smndc1Q8BGT7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms