Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc25a40Q8BGP6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms