Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynprQ8BGN8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynprQ8BGN8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynprQ8BGN8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynprQ8BGN8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SynprQ8BGN8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynprQ8BGN8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynprQ8BGN8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms