Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Best2Q8BGM5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Best2Q8BGM5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms