Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF8

Slc35d3, Solute carrier family 35 member D3, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35d3Q8BGF8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc35d3Q8BGF8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms