Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD5

Cpt1c, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, brain isoform, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt1cQ8BGD5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpt1cQ8BGD5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpt1cQ8BGD5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms