Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Katnb1Q8BG40 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms